曾经作为科搜研（科学搜查研究所）王牌活跃的土门诚，因某起事件辞去了科搜研的工作，如今经营着自己开设的 “土门鉴定所”。在这家土门鉴定所担任研究员的高仓柊子，学生时代学过心理学，擅长从举止和言行中识破他人的谎言。然而，即便是高仓，也唯独无法看透土门的心理……某天，神奈川县的海岸边打捞出一辆被水淹没的汽车。神奈川县警察搜查一课的巡查部长都丸勇人与系长三浦耕太郎赶到现场，在车内发现了一具白骨化的遗体，以及一个塞满贵金属的包。从残留物推测，这与 12 年前发生的一起抢劫杀人案有关。正如都丸等人所想，发现的贵金属被证实是 12 年前被抢走的物品。但此后一个月，搜查毫无进展，科搜研的鉴定也没有突破，搜查员们渐渐弥漫着放弃的情绪。于是，三浦指示意气消沉的都丸，委托 “土门鉴定所” 进行遗体的身份确认。然而，都丸对委托民间机构进行鉴定面露难色。对此，三浦对他说：“如果有证据证明土门诚无法鉴定，那其他人也绝对做不到。他有个绰号，叫‘最后的鉴定人’。”